在學術研究領域中，唯識有門派的分別，本文是以玄奘的《成唯識論》為主要的依據。因為自從《成唯識論》出版之後，中國早期的唯識學派，如攝論派、地論派等，差不多都消聲匿跡了。依目前學術界的考證，寒山子並非貞觀年間，而是大歷年間才到天台山隱居。所以，寒山子如果曾經接觸過唯識學，應該是玄奘系統的唯識學。
寒山詩中，與唯識有關的部分很多，甚至可以說，那些被人家以為與禪有關的詩也是跟唯識有關。因為「教外別傳，不立文字」的直指，才是禪宗的主要特色；一旦落入言詮，都屬於教門所攝，而教門當中，專門以語言文字講「心」的，就是唯識。寒山詩既是以語言文字的形式表現，當然是以教理為主；其中只有少部分在語言文字的意義之外有絃外之音的，才是「不立文字」的禪。（其中一首是〈時人見寒山〉(寒223)：「時人見寒山，各謂是風顛。貌不起人目，身唯布裘纏。我語他不會，他語我不言。為報往來者，可來向寒山。」為什麼說這是禪的直指呢？因為禪宗以開悟為知恩，悟後弘法為報恩，過去大家誤解寒山，今天既然想要回報寒山裝瘋賣傻指示禪機的恩德，只有開悟一條路。寒山既指示「來向寒山」可報恩，此四字必有語言文字相以外的深意。）寒山詩：「泉中且無月，月自在青天；吟此一曲歌，歌終不是禪！」即可支持這樣的論點。
底下引寒山詩，說明與唯識的關聯。
一、轉識有七，第八識為自性清淨心
〈我有六兄弟〉(寒246)：
我有六兄弟，就中一箇惡；打伊又不得，罵伊又不著。
處處無奈何，耽財好婬殺；見好埋頭愛，貪心過羅剎。
阿爺惡見伊，阿孃嫌不悅；昨被我捉得，惡罵恣情掣。
趁向無人處，一一向伊說：汝今須改行，覆車須改轍；
若也不信受，共汝惡合殺；汝受我調伏，我共汝覓活！
從此盡和同，如今遇菩薩；學業攻鑪冶，鍊盡三山鐵。
至今靜恬恬，眾人皆讚說。
有人以為這首詩是寒山自述其家庭成員，實則不然。若是真講兄弟中出了一個流氓，六兄弟圍起來打，怎麼會「打伊又不得，罵伊又不著」？實際上，這首詩是八個識的擬人化。就像《西遊記》中，沙悟淨象徵前五識，孫悟空象徵第六識，豬悟能象徵第七識，唐三藏象徵第八識，龍馬象徵色身。有人認為：此六兄弟為六識。如果是這樣，什麼又是「我」呢？六個兄弟，加上一個「我」，合起來應該是七個才對啊！
其實六兄弟是前五識和第七識。意識有理性、能觀察、能判斷、能夠反觀自己的存在，所以此詩隨順眾生稱之為「我」。末那識（第七識）恆緣現境，本身了別慧拙劣，沒有善惡可言；但若與前六識併存，則將前六識的了別性據為己有，恆於六塵境起貪瞋──特別貪愛人間的五欲。末那識並不像前六識那麼明顯，所以一般人無法觀察到它。例如有人沈迷於賭博，意識也知道賭博不好，拼命地起誓賭咒，但仍然戒不了賭；因為習氣是與末那識相應，與意識的關聯較小。對於一般人來說，末那識就是「打伊又不得，罵伊又不著」的惡兄弟，相當於《西遊記》中的豬八戒。
修行人在見道以前，不知道末那識的厲害。見道之後，意識已經知道六塵皆是無常，可是貪染的習氣卻一時除不掉，這時候才知道要對治末那識。「昨被我捉得，惡罵恣情掣」，表示意識已經找到末那識，知道染污末那識的種種過惡。「趁向無人處，一一向伊說：汝今須改行，覆車須改轍」，表示意識在引發習氣現起的一一境界相中，皆現觀分明，隨時提醒末那識，不要再度因為貪愛而引生無量無邊的苦惱。「從此盡和同，如今遇菩薩；學業攻鑪冶，鍊盡三山鐵。至今靜恬恬，眾人皆讚說」，表示意識已經調伏了末那識，使得末那識隨時轉依於自性清淨心，成為清淨末那識。
七兄弟（七轉識），加上菩薩（第八識），合起來便是八個識。這首詩是以擬人法，說出有情的八個識。而且，這應該是寒山以見道者的立場，描述自己降伏末那識染污習氣的經過。這表示寒山的證量，已非初見道者可比，他在解脫道方面的證量，至少在三果以上。
《大乘入楞伽經》說：「由依本識故，而有諸識生。」所以，八個識的地位是不平等的；依於第八識，七轉識方得出生，因此說七轉識為兄弟。（不過，此詩中的「阿爺」「阿孃」卻不能解釋為第八識，因為第八識是無覆無記性，不會去判別境界的善惡。譬喻總有其極限，不能夠面面皆適當。）
寒山另有一首詩〈有漢姓傲慢〉(寒76)：
有漢姓傲慢，名貪字不廉；一身無所解，百事被他嫌。
死惡黃連苦，生憐白蜜甜；喫魚猶未止，食肉更無猒。
表面上好像是在說一個惡人，但其實也是在說末那識。何以見得呢？《唯識三十論頌》說：
次第二能變，是識名末那；依彼轉緣彼，思量為性相。
四煩惱常俱，謂我癡我見，并我慢我愛，及餘觸等俱。
此中所說的四煩惱：我癡、我見、我慢、我愛，是指前六識不存在時（睡眠、悶絕等位）末那識所有的煩惱。末那識若與前六識併存，其煩惱不可勝數。
《成唯識論》說：
我癡者，謂無明；愚於我相，迷無我理，故名我癡。我見者，謂我執；於非我法妄計為我，故名我見。我慢者，謂踞傲；恃所執我，令心高舉，故名我慢。我愛者，謂我貪；於所執我，深生耽著，故名我愛。
世間並無以「傲慢」為姓者，故此漢非世間人，而是末那識。末那識有「我慢」常相隨逐，故說它以「傲慢」為姓。姓者，性也。「一身無所解」，係相應於「我癡」「我見」。「名貪字不廉」「百事被他嫌」「死惡黃連苦，生憐白蜜甜；喫魚猶未止，食肉更無猒」，則係相應於「我愛」。
〈我見利智人〉(寒300)：
我見利智人，觀者便知意；不假尋文字，直入如來地。
心不逐諸緣，意根不妄起；心意不生時，內外無餘事。
這首詩很難得的也提到末那識（意根）。此詩是說，利智的人看到禪師指示機鋒，當下便能會意，不需依靠文字，便證解第八識。「直入如來地」（不能理解為究竟成佛），意思就是證解第八識，因為第八識是如來與眾生共同的心地。利智的人證第八識之後，立刻就能轉依於第八識的真如性，前六識不攀緣六塵，意根也不妄起。七轉識不妄動，內外的煩惱皆能降伏。鈍根的人雖然也能證第八識，但無法轉依於第八識的真如性，會原地踏步很久，修證沒什麼進展。
寒山詩講末那識，學術界似乎還沒有人這麼理解過。因為寒山詩的用典，往往很冷僻，〈我有六兄弟〉和〈有漢姓傲慢〉講末那識也是如此，這是唯識學中難解的一門。